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基因芯片实验

产品介绍

基因芯片实验原理

  利用杂交的原理,即DNA根据碱基配对原则,在常温下和中性条件下形成双链DNA分子,但在高温、碱性或有机溶剂等条件下,双螺旋之间的氢键断裂,双螺旋解开,形成单链分子(称为DNA变性,DNA变性时的温度称Tm值)。变性的DNA黏度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加。当消除变性条件后,变性DNA两条互补链可以重新结合,恢复原来的双螺旋结构,这一过程称为复性。复性后的DNA,其理化性质能得到恢复。

利用DNA这一重要理化特性,将两个以上不同来源的多核苷酸链之间由于互补性而使它们在复性过程中形成异源杂合分子的过程称为杂交(hydridization)。杂交体中的分子不是来自同一个二聚体分子。由于温度比其他变性方法更容易控制,当双链的核酸在高于其变性温度(Tm值)时,解螺旋成单链分子;当温度降到低于Tm值时,单链分子根据碱基的配对原则再度复性成双链分子。因此通常利用温度的变化使DNA在变性和复性的过程中进行核酸杂交。

 

基因芯片实验数据分析(以miRNA芯片分析为例)

标准分析

芯片预处理与标准化;

筛选差异表达microRNA;

microRNA聚类图、火山图以及热图等;

对预测的microRNA的靶基因进行GO富集分析通路富集分析等。

个性化分析

1.microRNA网络分析:microRNA靶基因失调网络;microNRA功能协同作用网络。

2.microRNA与其他芯片整合分析:与lncRNAs芯片结果联合分析(ceRNA Analysis);与mRNA芯片整合分析;与DNA甲基化芯片结果联合分析。

3.与临床数据整合分析

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