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SNP实验外包

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SNP实验外包

SNP实验外包实验原理:

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)是指基因组上单个核苷酸的变异,人类基因组平均每1000个就有一个SNP。它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变,使得群体之间和个体之间产生了差异。其中转换和颠换发生频率较高,转换是指同型碱基之间的转换,即嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶间;颠换是指发生在嘌呤与嘧啶之间的替换。事实上转换的发生频率占多数,且CG序列上出现的SNP为频繁,而且多是C转换为T,原因是CG中的C常因为甲基化自发地脱氨基后即成为胸腺嘧啶。

 

实验流程:

1、直接测序法
1)样品基因组DNA提取;
2)根据不同的区域进行引物设计、合成;
3)对样品进行基因扩增并纯化;
4)测序;
5)统计与分析。
2PCR-RFLP分型法
1PCR反应;
2PCR产物的酶切;
3)琼脂糖凝胶电泳检测。
3TaqMan探针分型法(定量PCR
1DNA抽提和质检
2)引物/TaqMan探针设计与合成
3)荧光定量PCR检测
4)测序
5)统计与分析。
4Multiplex SNaPshot分型法
1DNA抽提和质检
2)扩增、延伸引物的设计合成
3)扩增和延伸反应
4)测序仪测序
5)数据统计与分析。

 

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