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    如何30分钟整出一篇5分的蚊帐?

    点击次数:990 发布时间:2017-11-16

              如何30分钟整出一篇5分的蚊帐?

      没错,我就是花了大概30分钟做了篇5分的文章的.说起来你大概有那么点半信半疑……水友们都已经跃跃欲试,整装待发了!好的,我给你们演示一下要怎么做哈。

      先打开GEO挑一个芯片,嗯,没错,一个就差不多够了。然后用GEO2R来分析一下:

        分析获得的结果呢,大概就是这样的:

        然后下载下来,接着用Excel做一下筛选,q值小于0.05,LogFC值要大于2。

        筛出来的这些基因马上到DAVID上去分析一下GO term和KEGG Pathway。

         接着,打开STRING,然后做一下PPI分析,由于基因数量比较多,所以等了会儿。

        下载了这些PPI数据后,直接用Cytoscape打开,导入到里面后,用MCODE稍微算一下,就形成了这样的关键性子网络

        然后点开KM-Plot,算一下上面那张图里几个关键基因的生存曲线

       时间不多了,打开这个工具,然后看看这几个关键基因是不是在胃癌中都表达比   较高。先点进去选择生成箱状图:

    接着选一下胃癌:

    然后搞定:

    没错,胃癌中确实高表达。然后我们搜搜看和这个基因相关的别的基因的相关性吧……

    好啦,收工!接下去就用半年来写文章吧……嗯,是这样的。

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